Descripción de pruebas moleculares en el diagnóstico del virus Zika en el periodo 2008-Febrero 2018. Revisión sistemática

Contenido principal del artículo

Autores

Juan c. Pereira Palacio
Lady J. Gaviria Mejía
Sebastián Zea-Castrillón
Patricia E. Jaramillo Arbleáez
Astrid Bedoya

Resumen

Objetivo. Describir las pruebas moleculares usadas desde 2008 para la detección del virus Zika reportadas en artículos indexados en 3 bases de datos. Métodos. Se realizó la búsqueda de literatura científica utilizando el método PRISMA durante el periodo 2008 – febrero de 2018, en las bases de datos Pubmed, Science Direct y Embase, usando como criterios de inclusión artículos originales publicados entre los años 2008 a 2018 que realicen investigación en humanos con sospecha de infección por ZIKV y que describan la prueba molecular utilizada. Resultados. A partir de una búsqueda inicial de 2617 artículos recolectados con las palabras clave y aplicar los criterios de inclusión y exclusión, se seleccionan 18 artículos, de los cuales 8 son de Science Direct, 4 de Embase y 6 de Pubmed. Se describe la RT-PCR como la técnica más utilizada, se hallaron 9 blancos moleculares diferentes utilizados en las pruebas y 7 muestras biológicas de las cuales se pudo amplificar el genoma viral. Conclusiones. Hasta el momento la RT-PCR es la técnica más utilizada para el diagnóstico de la infección por el virus Zika al ser la más estandarizada y presentar una alta sensibilidad y especificidad, sin embargo se sigue trabajando sobre otras técnicas que garanticen la detección oportuna del virus, usando diferentes genes como el gen E, NS5, NS1, NS2B NS3, NS4B y CPREM principalmente en suero y orina.

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Referencias

1. Kantor IN. Dengue, (2016);76(2):93–7.

2. OMS. Preguntas y respuestas sobre el virus de Zika y sus complicaciones [Internet]. (2017). Available from: http://www.who.int/features/qa/zika/es

3. Bobek, V., Kolostova, K., Pinterova, D., Kacprzak, G., Adamiak, J., Kolodziej, J., ... Hoffman, R. M. (2010). A clinically relevant, syngeneic model of spontaneous, highly metastatic B16 mouse melanoma. Anticancer Research, 30(12), 4799–4804. https://doi.org/10.1002/jmv

4. Salud, A. de M. y. (2016). Virus de Zika. Retrieved from http://www.microbiologiaysalud.org/noticias/virus-de-zika/

5. Grillet, M. E., & Ventura, F. Del. (n.d.). Transmisión del virus Zika : Patrones y mecanismos eco-epidemiológicos de una arbovirosis, 17(2).

6. OMS. Enfermedad por el virus zika [Internet]. (2016). Available from: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/zika/es/

7. Nogueira, M. L., Nery Júnior, N. R. R., Estofolete, C. F., Bernardes Terzian, A. C., Guimarães, G. F., Zini, N., ... Ko, A. I. (2018). Adverse birth outcomes associated with Zika virus exposure during pregnancy in São José do Rio Preto, Brazil. Clinical Microbiology and Infection, 1–7. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2017.11.004

8. Instituto Nacional de Salud c. Boletin Epidemiologico Semanal BES. Semana Epidemiologica 11 de 2018. (2018).

9. OMS. Enfermedad por el virus zika [Internet]. (2016). Available from: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/zika/es/

10. Alejo-Cancho, I., Torner, N., Oliveira, I., Martínez, A., Muñoz, J., Jane, M., ... Martínez, M. J. (2016). Twenty-four cases of imported zika virus infections diagnosed by molecular methods. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 86(2), 160–162. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2016.07.016

11. Waggoner, J. J., Gresh, L., Mohamed-Hadley, A., Ballesteros, G., Davila, M. J. V., Tellez, Y., ... Pinsky, B. A. (2016). Single-Reaction Multiplex Reverse Transcription PCR for Detection of Zika, Chikungunya, and Dengue Viruses. Emerging Infectious Disease Journal, 22(7), 1295. https://doi.org/10.3201/eid2207.160326

12. Cabral-Castro, M. J., Cavalcanti, M. G., Peralta, R. H. S., & Peralta, J. M. (2016). Molecular and serological techniques to detect co-circulation of DENV, ZIKV and CHIKV in suspected dengue-like syndrome patients. Journal of Clinical Virology, 82(December 2015), 108–111. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2016.07.017

13. Duffy, M.R., Chen, T.H., Hancock, W.T., Powers, A.M., Kool, J.L., Lanciotti, R.S., (2009) Zika virus outbreak on Yap Island, Federated States of Micronesia. N Engl J Med.360:2536–43.DOIPubMed

14. Zanluca, C., Melo, V.C., Mosimann, A.L., Santos, G.I., Santos, C.N., Luz, K., (2015) First report of autochthonous transmission of Zika virus in Brazil. Mem Inst Oswaldo Cruz.,110:569–72. DOIPubMed

15. Balmaseda, A., Zambrana, J. V., Collado, D., García, N., Saborío, S., Elizondo, D., ... Harris, E. (2018). Comparison of four serological methods and two reverse transcription-PCR assays for diagnosis and surveillance of Zika virus infection. Journal of Clinical Microbiology, 56(3). https://doi.org/10.1128/JCM.01785-17

16. Dejnirattisai, W., Supasa, P., Wongwiwat, W., Rouvinski, A., Barba-Spaeth, G., Duangchinda, T., ... Screaton, G. R. (2016). Dengue virus sero-cross-reactivity drives antibody-dependent enhancement of infection with zika virus. Nature Immunology, 17(9), 1102–1108. https://doi.org/10.1038/ni.3515

17. Gourinat, A.-C., O’Connor, O., Calvez, E., Goarant, C., & Dupont-Rouzeyrol, M. (2015). Detection of Zika virus in urine. Emerging Infectious Diseases, 21(1), 84–86. https://doi.org/10.3201/eid2101.140894

18. Lanciotti, R. S., Kosoy, O. L., Laven, J. J., Velez, J. O., Lambert, A. J., Johnson, A. J., ... Duffy, M. R. (2008). Genetic and serologic properties of Zika virus associated with an epidemic, Yap State, Micronesia, 2007. Emerging Infectious Diseases, 14(8), 1232–1239. https://doi.org/10.3201/eid1408.080287

19. Gyurech, D., Schilling, J., Schmidt-Chanasit, J., Cassinotti, P., Kaeppeli, F., & Dobec, M. (2016). False positive dengue NS1 antigen test in a traveller with an acute Zika virus infection imported into Switzerland. Swiss Medical Weekly, 146(February), w14296. https://doi.org/10.4414/smw.2016.14296

20. Rossini G, Gaibani P, Vocale C, Cagarelli R, Landini MP. Comparison of Zika virus (ZIKV) RNA detection in plasma, whole blood and urine – Case series of travel-associated ZIKV infection imported to Italy, (2016). J Infect [Internet]. 2017;75(3):242–5. Available from: http://dx.doi.org/10.1016/j.jinf.2017.05.021

21. Rodríguez, P. H. (n.d.). tecnicas moleculares: un avance en el diagnostico y conocimineto de patlogias oculares patricia hernandez rodriguez Ms.

22. Costa J. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) a tiempo real. Enfermedad Infecciosa Microbiologia Clinica [Internet]. (2004);22(5):299–305. Available from: http://db.doyma.es/cgi-bin/wdbcgi.exe/doyma/mrevista.fulltext?pident=13059826

23. Erlich HA. Polymerase chain reaction. J Clin Immunol. (1989) Nov;9(6):437–47.

24. Sánchez E, Nina M, Aguirre P, Arce M, Toro N, Vilela R. Un (1) vial que contiene anticuerpo purificado con afinidad enzimática e IgG monoclonal de ratón marcado con biotina en buffer, colorante y preservante. Almacenaje a 2-8oC. (n.d.), 3–5.Amplificación isotérmica mediada por LOOP (LAMP) de ácidos nuclecios e. Rev Ciencias Farm y Bioquímicas. (2014);2:127–40.

25. Fundación Wikimedia I. Transcriptasa Inversa. 09 Marzo [Internet]. (2013);1. Available from: http://es.wikipedia.org/wiki/Transcriptasa_inversa

26. Jia, H., Zhang, M., Chen, M., Yang, Z., Li, J., Huang, G., ... Song, T. (2018). Zika virus infection in travelers returning from countries with local transmission, Guangdong, China, 2016. Travel Medicine and Infectious Disease, 21(November 2017), 56–61. https://doi.org/10.1016/j.tmaid.2017.11.012

27. L’Huillier, A. G., Lombos, E., Tang, E., Perusini, S., Eshaghi, A., Nagra, S., ... Gubbay, J. B. (2017). Evaluation of altona diagnostics RealStar zika virus reverse transcription-PCR test kit for Zika virus PCR testing. Journal of Clinical Microbiology, 55(5), 1576–1584. https://doi.org/10.1128/JCM.02153-16

28. Fascher, S., Landt, O., Niedrig, M., Pmda, Z., Cp, C., Aa, S., ... Giorgi, R. R. (2017). Rapid Molecular Detection of Zika Virus in Acute ¬ Phase Urine Samples Using the Recombinase Polymerase Amplification Assay. Plos Currents Outbreaks, 1–10. https://doi.org/10.1371/currents.outbreaks.a7f1db2c-7d66c3fc0ea0a774305d319e.Authors

29. Lanciotti, R. S., Kosoy, O. L., Laven, J. J., Velez, J. O., Lambert, A. J., Johnson, A. J., ... Duffy, M. R. (2008). Genetic and serologic properties of Zika virus associated with an epidemic, Yap State, Micronesia, 2007. Emerging Infectious Diseases, 14(8), 1232–1239. http://doi.org/10.3201/eid1408.080287

30. Faye, O., Faye, O., Diallo, D., Diallo, M., Weidmann, M., & Sall, A. A. (2013). Quantitative real-time PCR detection of Zika virus and evaluation with field-caught Mosquitoes. Virology Journal, 10(1), 1. https://doi.org/10.1186/1743-422X-10-311

31. Corman, V. M., Rasche, A., Baronti, C., Aldabbagh, S., Cadar, D., Reusken, C. B., ... Drexler, J. F. (2016). Assay optimization for molecular detection of Zika virus. Bulletin of the World Health Organization, 94(12), 880–892. https://doi.org/10.2471/BLT.16.175950

32. Organización Panamericana de la Salud O, Organización Mundial de la Salud O. Zika - Actualización Epidemiológica. Organ Panam la Salud/Organización Mund la Salud. 2017;1–5.

33. Universidad de Buenos Aires. Factores ecológicos que afectan la persistencia y la abundancia de Aedes aegypti en la región templada [Internet]. Available from: http://server.ege.fcen.uba.ar/gem/html/investigacion_aedes factores.html

34. Colombo, T. E., Terzian, A. C. B., Júnior, J. P. A., Parreira, R., Cabrera, E. M. S., Santos, I. N. P. dos, ... Nogueira, M. L. (2018). Zika detection: comparison of methodologies. Brazilian Journal of Microbiology, 49(1), 144–147. https://doi.org/10.1016/j.bjm.2017.04.011

35. Kurosaki Y, Martins DBG, Kimura M, Catena ADS, Borba MACSM, Mattos SDS, et al. Development and evaluation of a rapid molecular diagnostic test for Zika virus infection by reverse transcription loop-mediated isothermal amplification. Sci Rep. 2017;7(1):1–10.

36. Tian, B., Qiu, Z., Ma, J., Zardán Gómez de la Torre, T., Johansson, C., Svedlindh, P., & Strömberg, M. (2016). Attomolar Zika virus oligonucleotide detection based on loop-mediated isothermal amplification and AC susceptometry. Biosensors and Bioelectronics, 86, 420–425. https://doi.org/10.1016/j.bios.2016.06.085

37. Wang, X., Yin, F., Bi, Y., Cheng, G., Li, J., Hou, L., ... Yang, L. (2016). Rapid and sensitive detection of Zika virus by reverse transcription loop-mediated isothermal amplification. Journal of Virological Methods, 238, 86–93. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2016.10.010

38. Calvert, A. E., Biggerstaff, B. J., Tanner, N. A., Lauterbach, M., & Lanciotti, R. S. (2017). Rapid colorimetric detection of Zika virus from serum and urine specimens by reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP). PLoS ONE, 12(9), 1–16. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0185340

39. Bernal Luz Mery, López Greizy. Diagnóstico prénatal: retrospectiva. Nova. 2014; 12( 21 ): 23-36.

40. Márquez Gómez Marco Antonio, Gómez Díaz Graciela María. Accidente ofídico en el departamento de Sucre, Colombia. Nova. 2015; 13( 24 ): 39-46.

41. Pinilla B Gladys, Chavarro P Bibiana, Moreno A Natalia, Navarrete O Jeannette, Muñoz M Liliana. Determinación de los genes, 16S ADNr, polA, y TpN47, en la detección de Treponema pallidum subsp. pallidum para el diagnóstico de sífilis congénita. Nova. 2015; 13( 24 ): 17-25.

42. Corrales Lucia Constanza, Antolinez Romero Diana Marcela, Bohórquez Macías Johanna Azucena, Corredor Vargas Aura Marcela. Bacterias anaerobias: procesos que realizan y contribuyen a la sostenibilidad de la vida en el planeta. Nova. 2015; 13( 24 ): 55-81.

43. González Yuri Lilian. Evaluación de la percepción del riesgo ocupacional en trabajadores de una empresa del sector de la construcción en Bogotá D.C. Nova. 2015; 13( 23 ): 93-107.

44. Abd El Wahed, A., Sanabani, S. S., Faye, O., Pessôa, R., Patriota, J. V., Giorgi, R. R., ... Weidmann, M. (2017). Rapid Molecular Detection of Zika Virus in Acute-Phase Urine Samples Using the Recombinase Polymerase Amplification Assay. PLoS Currents, 9, ecurrents.outbreaks.a7f1db2c7d66c-3fc0ea0a774305d31. https://doi.org/10.1371/currents.out-breaks.a7f1db2c7d66c3fc0ea0a774305d319e

45. Musso D, Rouault E, Teissier A, Lanteri MC, Zisou K, Broult J, et al. Molecular detection of Zika virus in blood and RNA load determination during the French Polynesian outbreak. J Med Virol. 2017;89(9):1505–10.

46. Carrero Sandra Helena Suescún, HerediaMontoya Dina Paola, Bolaños Yoryany Mulato, Medellín Martín Orlando Pulido. Seroprevalencia de infección por Leptospira y factores de riesgo en estudiantes de una universidad de Colombia. Nova. 2017; 15( 27 ): 131-138.

47. Naranjo Flórez Ricardo Andrés. Avances y perspectivas en Síndrome de Asperger. Nova. 2014; 12( 21 ): 81-101.

48. Zuluaga Martha, Robledo Sebastian, Osorio-Zuluaga German A, Yathe Laura, Gonzalez Diana, Taborda Gonzalo. Metabolomics and pesticides: systematic literature review using graph theory for analysis of references. Nova. 2016; 14( 25 ): 121-138.

49. George, K. S., Sohi, I. S., Dufort, E. M., Dean, A. B., White, J. L., Limberger, R., ... Zucker, A. (2017). crossm Zika Virus Testing Considerations : Lessons Learned from the First 80 Real- Time Reverse Transcription-PCR-Positive Cases Diagnosed in New York State, 55(2), 535–544. https://doi.org/10.1128/JCM.01232-16

50. Calvo, E. P., Sánchez-Quete, F., Durán, S., Sandoval, I., & Castellanos, J. E. (2016). Easy and inexpensive molecular detection of dengue, chikungunya and zika viruses in febrile patients. Acta Tropica, 163, 32–37. https://doi.org/10.1016/J.ACTATROPICA.2016.07.021

51. Musso, D., Roche, C., Nhan, T. X., Robin, E., Teissier, A., & Cao-Lormeau, V. M. (2015). Detection of Zika virus in saliva. Journal of Clinical Virology, 68, 53–55. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2015.04.021

52. Ávila de Navia Sara Lilia, Estupiñán-Torres Sandra Mónica, Díaz González Liliana. Calidad bacteriológica del agua Vereda El Charco, San Miguel de Sema, Boyacá- Colombia. Nova. 2016; 14( 25 ): 139-145.

53. Almonacid Urrego Carmen Cecilia, Camarillo Romero María del Socorro, Gil Murcia Zulay, Medina Medina Claudia Yasmin, Rebellón Marulanda Jennifer Viviana, Mendieta Zerón Hugo. Evaluación de factores de riesgo asociados a enfermedad cardiovascular en jóvenes universitarios de la Localidad Santafé en Bogotá, Colombia. Nova. 2016; 14(25): 9-17.

54. González Devia Johanna L., Monroy Romero Paola A., Almonacid Urrego Carmen C.. Homocisteína y otros factores de riesgo cardiovascular en niños de educación básica primaria del Colegio Distrital Manuel Elkin Patarroyo, Bogotá, D.C. Colombia. Estudio piloto. Nova. 2017 ; 15( 27 ): 103-117.

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